אגף אכיפה במשרד החינוך הגיש תלונה במשטרה נגד בית הספר היסודי לפליטות במזרח ירושלים, אשר פועל מטעם הווקף ומתוקצב על ידו. נציין כי עצם התלונה באה בעקבות הפרסום ב"ישראל היום" אודות בית הספר, שציין את "יום השהיד הפלשתיני" וערך פעילויות בנושא.
במסגרת התלונה בהנחיית שר החינוך, יואב גלנט, המשרד מבקש מהמשטרה לזמן לחקירה את מנהל בית הספר וצוות החינוך המעורבים בפעילות שעוסקת בהסתה נגד מדינת ישראל בין כותלי בית הספר. גלנט הבהיר כי "לא נאפשר למוסד חינוכי באשר הוא להסית נגד מדינת ישראל ולעודד לאלימות. אמצה את הדין עם כל מוסד ומוסד שכזה, גם עם אלה שאינם תחת אחריות משרד החינוך, כמו במקרה של בית הספר לתלמידות פליטות במזרח ירושלים".
כחלק מהפעילות של בית הספר היסודי, הוא ביקש מתלמידותיו להכין מצגות זיכרון למחבלים, וכינה אותם "שהידים". התלמידות העלו במצגות תמונות ממסעות קבורה של מחבלים בליווי שירי הלל ופסוקים המשבחים את מעשה "השהיד".
אחת מתלמידות כיתה ה׳ אף תיארה את התפתחות הנושא החל מדמותו של הטרוריסט ואיש הדת המוסלמי, עז א-דין אל-קסאם, דרך ראש אש"ף יאסר ערפאת וה"שהיד" בהאא עליאן, המחבל שביצע את הפיגוע הקטלני בקו 78 בירושלים בו נרצחו שלושה ישראלים.
על לפי סעיף 144 לחוק העונשין, החומר שנאסף מעלה שפעילותו של בית הספר מהווה מסע הסתה, שכולל עידוד למעשה אלימות, בין היתר, באמצעות דברי שבח, אהדה או עידוד למעשה אלימות, תמיכה בו או הזדהות עמו.
מאור צמח, יו"ר ארגון "לך ירושלים", אמר: "אני מברך את השר יואב גלנט על פעילותו הנחושה בגילויי ההסתה בבתי הספר במזרח ירושלים. ארגון 'לך ירושלים' אשר חשף את הפעילות המסיתה הזו קורא לשר גלנט ולממשלה להסדיר מנגנון פיקוח על תכני הלימוד בכלל בתי הספר במזרח ירושלים. כל בתי ספר שתתגלה בהם הסתה ייסגרו לאלתר".
תנועת "אם תרצו" מסרה בתגובה: "מזרח ירושלים הוא חלק בלתי נפרד ממדינת ישראל ואינו אקס טריטוריה בה לממשלה אין שליטה. הגיע הזמן להוציא כרטיס אדום לפעילות הווקף ושאר הגורמים האנטי ישראלים הזרים הפועלים בבירת ישראל. לא יעלה על הדעת שאותם גורמים ימשיכו לחתור נגד המדינה. על המשטרה לפתוח בחקירה לאלתר".