ברכבת ישראל שוקלים להקדים את ההרשמה לנסיעה למחר בעקבות חששות בקרב נוסעים שומרי מסורת. הסיבה לכך היא שההרשמה שתיפתח החל מ-48 שעות לפני החזרה לפעילות ביום שני, תתחיל בבוקר שבת. על כן יש חשש כי מי ששומר שבת לא יספיק להירשם למכסות ה-500 איש והמקומות הפנויים יאזלו עוד לפני מוצ"ש. כמו כן, בהנהלה שוקלים לצמצם את המכסה בכמה עשרות נוסעים כדי לא לחרוג מהמגבלה שנקבעה.
בנוסף, הנהלת הרכבת ביקשה שוב מציבור הנוסעים להגיע לתחנות לפחות חצי שעה לפני מועד הנסיעה. ברכבת צופים עומסים בכניסות לתחנות עקב בדיקות החום והצגת האישורים המתאימים. מחר הרכבת עתידה לבצע סימולציות בהשתתפות העובדים כדי לבדוק שכל הנושאים ובעיקר ההרשמה לנסיעה, אכן פועלים כתקנם.
לאחר אישור המתווה החדש ברביעי האחרון על ידי קבינט הקורונה, הרכבת חוזרת לפעול באופן מלא להוציא את תחנת נתב"ג שתישאר סגורה וכן קווי השרון שנמצאים תחת עבודות תשתית. ברכבת שואפים לסיים את העבודות עד ה-1 ביולי, אם יתאפשר. לעת עתה בשל עובדה זו, רכבות יסתיימו בתחנת ראש העין ולא ברעננה.
הגבלה אחרת תהיה ברכבות ציר החוף, שלא יפעלו לאחר השעה 21:00 ובסופי השבוע. עקב אי הפעלת מסילה זו, רכבות מדרום יסיימו את נסיעתם בתחנת תל אביב סבידור ומצפון בתחנת בית יהושע. בין התחנות יופעלו שאטלים.

בין ההגבלות שיוטלו על הנוסעים החל מיום שני בשבוע הבא: איסור על אכילה ושתייה, חובת חבישת מסכה, חובה להנפיק שובר כניסה ולשמור על היגיינה וריחוק חברתי. כמו כן, הנוסעים יידרשו להימנע מנסיעה במקרה של תסמיני מחלה. הנפקת האישור תתקיים על בסיס מילוי מספר תעודת הזהות. בדרך זו מתכננים להגביל את מספר הנוסעים בכל רכבת ל-500. ומעבר לכך – לא יינתנו אישורים.
הנפקת השובר תתאפשר החל מ-48 שעות ממועד הנסיעה באמצעות כפתור ייעודי, שיתווסף לתצוגת הרכבות הנבחרות בתוצאות תכנון מסלול הנסיעה באתר האינטרנט או ביישומון של רכבת ישראל. לא תתאפשר הזמנת שובר מוקדם מיומיים לפני הנסיעה, כמובן בכפוף להימצאות מקומות פנויים ברכבת.
כמו כן, ניתן יהיה להזמין שובר נסיעה במוקד שירות הלקוחות במספר *5770 או באמצעות עמדות הנפקה שייפרסו בתחנות מרכזיות ברחבי הארץ. לאחר ההזמנה, יישלח השובר באמצעות מסרון לטלפון הנייד או לתיבת הדואר האלקטרוני של הנוסע יחד עם ברקוד. את השובר יש להדפיס או להציג באמצעות הטלפון הסלולרי בכניסה לתחנה.
ברכבת ישראל הדגישו כי לא תתאפשר כניסה לתחנה ללא הצגת שובר כניסה התואם לזמני הרכבות בתחנה. בהקשר זה, נוסע שיאחר את מועד הרכבת עבורה הוזמן השובר, ינפיק שובר חדש ומעודכן לרכבת הבאה בכפוף למגבלת 500 הנוסעים.