היחידה הארצית של משטרת ישראל עיכבה הבוקר לחקירה 14 חשודים, בהם ח"כ לשעבר, עובד בכיר לשעבר בנתיבי ישראל ובכירים במגוון חברות פרטיות המספקות או סיפקו שירותים לנתיבי ישראל, זאת בעקבות התפתחות חקירתית שהושגה בשלהי חקירת הפרשה והבשילה כעת לכדי ביסוס חשד לתת פרשה נוספת של חשד לשוחד, בשיטה דומה לזו שנחקרה ובעניינה גובשה תשתית ראייתית לביצוע מגוון עבירות על ידי שורת מעורבים.
החקירה חשפה וביססה תשתית ראייתית לכאורה למנגנון שיטתי ומאורגן של העברות כספי מדינה וגריפת רווחים מסוגים שונים בהיקפים הנאמדים במאות מיליוני שקלים. החקירה חשפה התנהלות פלילית שיטתית ושחיתות עמוקה לכאורה שהייתה נהוגה בחברת נתיבי ישראל במשך למעלה מעשור, תחת כהונתם של מספר מנכ"לים ובמעורבות מגוון גורמים ברבדים שונים בחברה ביניהם בכירים, מנהלים, עובדים זוטרים ומי שאמורים היו להיות "שומרי הסף" וכן יועצים, ספקים ונותני שירותים למיניהם, זאת תוך ביצוע שורת עבירות ובהן מתן ולקיחת שוחד, קבלת דבר במרמה בנסיבות מחמירות, רישום כוזב במסמכי תאגיד, סחיטה באיומים, עבירות לפי חוק איסור הלבנת הון, מרמה והפרת אמונים, הפרת אמונים בתאגיד, עבירות על פקודת מס הכנסה.
בשלהי החקירה, הושגה התפתחות אשר העלתה חשד לתת-פרשה נוספת של שוחד בהקשר לקידום העסקתם של חברות כספקי שירות במסגרת פרוייקטים רחבי היקף ועתירי ממון בנתיבי ישראל, בתמורה לשוחד. על פי החשד, בכיר לשעבר בחברה, אשר לימים פוטר, פעל בצוותא עם מעורבים נוספים המקורבים אליו ולבכירים בחברה לקידום העסקתם של החברות הפרטיות, בניגוד לכללים ולחוקי המכרזים, זאת בתמורה לכספים שהועברו אליהם ול"גזירת קופון" מהעסקאות.
במסגרת הפעילות הבוקר ערכו כוחות משותפים של המשטרה וחקירות מס הכנסה תל אביב ברשות המסים חיפושים בבתי החשודים ובחברות ותפסו בין היתר מסמכים, כסף מזומן בשווי עשרות אלפי שקלים ורכוש לצורך בקשות חילוט בהמשך.
בימים האחרונים עצרה היחידה חשוד, בעל חברה פרטית, בחשד למעורבות בפרשה ובית המשפט האריך את מעצרו עד ליום 22.1.17 ואסר לפרסום את פרטיו לבקשת עורך דינו.