לאחר שהצליח לדכא את ההפיכה הצבאית, ארדואן מנצל את ההזדמנות לנקות את המוסדות השונים במדינה וגל מעצרים נרחב מתבצע ברחבי המדינה.
טורקיה עצרה עשרה חברים במועצת המדינה, בית המשפט המנהלי העליון במדינה, ונערכים חיפושים אחר 140 חברים בבית הדין הגבוה לערעורים כחלק מחקירת ניסיון ההפיכה הצבאית הכושל. כך דיווח ערוץ טלויזיה טורקי. המעצרים האלה באים לאחר דיווחים על מבצע מעצרים נרחב נגד שופטים בבתי משפט שונים.
מוקדם יותר דווח כי טורקיה השעתה מתפקידם 2,745 שופטים. עוד דווח כי ההחלטה על ההשעיה נעשתה על ידי מועצה בכירה של שופטים ושל פרופסורים. סוכנות הידיעות הטורקית אנאדולו דיווחה כי חמישה חברים במועצה השיפוטית הגבוהה ביותר במדינה איבדו את תפקידם.
עד כה הודיעה הממשלה הטורקית כי יותר מ-2,800 בני אדם נעצרו ו-161 נהרגו בניסיון ההפיכה ובדיכויו.
ממשלת טורקיה ציינה כי פעילים של "תשתית מקבילה" בקרב שורות הצבא הם שעומדים מאחורי הניסיון להפיל את שלטון ארדואן, והנשיא מתח אצבע מאשימה אל יריבו הפוליטי הגולה, גילן.
במקביל, המשטרה הטורקית עצרה כ-100 קציני צבא בבסיס של חיל האוויר בדיארבקיר שבדרום מזרח המדינה, אותו בסיס ממנו יצאו בשנה האחרונה מטוסי קרב להפציץ יעדים של המיליציה הכורדית. כך מסר גורם ביטחוני. הוא הוסיף כי נעשו מעצרים גם בבסיסים אחרים.