במהלך הלילה (בין שני לשלישי) צה״ל ביצע תקיפה ממוקדת בהכוונה מודיעינית אל עבר מספר מחבלים בכירים בארגון הטרור חמאס, שפעלו מתוך מתחם פיקוד ושליטה שהוסווה במרחב ההומינטרי בחאן יונס.
בדובר צה"ל מדגישים כי המספרים שמפרסם משרד ההסברה העזתי של ארגון הטרור חמאס כי ישנם 40 הרוגים בתקיפה, לא עולים בקנה אחד עם המידע הקיים בצה״ל, החימושים המדויקים בהם נעשה שימוש והדיוק בפגיעה. לטענתם, הנתונים של משרד ההסברה העזתי כבר הוכחו כשקריים מספר פעמים.
בין הבכירים שהותקפו - המחבל סאמר אסמעיל חדר אבו-דקה, ראש מערך האווירי של ארגון הטרור חמאס ברצועת עזה, המחבלים אסאמה טבש, ראש מחלקת התצפיות והמטרות במטה המודיעין הצבאי של ארגון הטרור חמאס, והמחבל אימן מבחוח, בכיר נוסף בארגון הטרור חמאס. מחבלים אלו היו מעורבים באופן ישיר בטבח ה-7 באוקטובר, ופעלו להוצאת מתווי טרור נגד כוחות צה"ל ומדינת ישראל במהלך התקופה האחרונה.
טרם התקיפה בוצע איסוף מודיעין ממושך, וכן תצפית אווירית רצופה בשעות שקדמו לתקיפה באופן שאימת את הימצאותם במרחב לצד מחבלים נוספים.
למרות האמצעים הרבים שצה״ל נוקט על מנת לאפשר לתושבי עזה להתרחק מאיזורי קרב, ובהם הגדרת האיזור ההומניטרי, ארגון הטרור החמאס ממשיך להטמיע את הפעילים והתשתיות הצבאיות שלו באזור ההומניטרי, ולהשתמש באזרחים כמגן אנושי באופן שיטתי.