עם פתיחת מבצע עוז וחרב, חוסלו בעזה כמה בכירים בחמאס מקרב הזרועות "האזרחיות" שלו. הבכיר שבהם היה עיסאם דאעליס, "ראש ממשלת הצללים", שנהרג בתקיפה עם בני משפחתו במרכז הרצועה. בין ההרוגים היו גם גורמים במנגנוני הפנים, מוחמד אבו ווטפה, אבו עבידה אל-ג'מאסי ובהג'סת אבו סולטאן.
לקראת המבצע הנוכחי נותרו שורה של בכירים שנמצאים על הכוונת של ישראל. בראשם ניתן למנות את מוחמד סינוואר, אחיו של מנהיג חמאס שחוסל, יחיא סינוואר, ומי שנחשב לראש הזרוע הצבאית החדש בחמאס. מוחמד סינוואר נחשב לדמות הבכירה בארגון הטרור בעזה, ואחד מגורמי המפתח במשא ומתן לעסקת חטופים. בעבר שימש מוחמד סינוואר בתור מפקד חטיבת חאן יונס בזרוע, ובשלב מסוים מונה למפקד של גזרת דרום הרצועה. עם חיסולם של מוחמד דף וסגנו מרואן עיסא, סינוואר הפך לדמות הבכירה בזרוע.
הדמות השנייה ברשימת המבוקשים היא עז א-דין אל-חדאד, מח"ט העיר עזה בעבר, וכיום המפקד הבכיר בגזרת צפון הרצועה כולה. אל-חדאד שרד לפחות ניסיון חיסול אחד. בינואר הוא התראיין לרשת "אל-ג'זירה" וחשף פרטים מתכנון טבח 7 באוקטובר. הוא התייחס בין היתר לשאלת הידיעה של איראן וחיזבאללה על מתקפת הטרור, ואמר כי "בהתחשב בהיקף הגדול ובהשלכות הצפויות של המתקפה - האחים בציר ההתנגדות עודכנו בתמונת המצב. (אבל) שמרנו על עיתוי שעת האפס אצלנו במעגל הצר ביותר כדי להבטיח את הצלחת המתקפה".
הדמות השלישית בזרוע הצבאית של חמאס שלא חוסלה היא מוחמד שבאנה, מפקד חטיבת רפיח. שבאנה שרד ניסיון חיסול במהלך המלחמה, אבל כמו יחידות אחרות בצבא הטרור, החטיבה שלו פורקה כשרבים מהמפקדים והמחבלים חוסלו על ידי צה"ל. כמו בגזרות אחרות, חמאס ניסה לשקם יכולות גם בדרום הרצועה.
בכיר אחר בחמאס, שאחראי למנגנוני הפנים הוא תאופיק אבו נעים. מדובר במשוחרר נוסף מעסקת שליט וממקורביו של יחיא סינוואר. הוא היה ממייסדי הזרוע הצבאית וישב בכלא יותר מ־20 שנה כשנידון למאסר עולם בגין רצח משתפי פעולה פלשתינים. ככל הידוע נעים לא עזב את רצועת עזה. עם זאת, כמה מראשי המנגנונים שתחתיו חוסלו.
דמות נוספת שהיתה נתונה לניסיון חיסול הוא ראא'ד סעד, בעבר מח"ט העיר עזה ומי ששימש בתור ראש מטה ייצור הנשק. בקיץ האחרון הוא הותקף בצפון רצועת עזה. עד כה לא התקבל אימות למותו, כך שייתכן שהוא עדיין חי.
בגזרת הלשכה המדינית בעזה, כפי שפרסמנו ב"ישראל היום", מרבית חבריה נהרגו בתקיפות או ברחו מעזה לפני פרוץ המלחמה. במהלך הפסקת האש, התגלה כי מחמוד א-זהאר, אחד ממייסדי חמאס וחבר בלשכה, עדיין חי. זאת למרות דיווחים על מצבו הרפואי בשל גילו המתקדם.
חבר נוסף בלשכה שלא חוסל הוא איסמעיל ברהום, ראש אגף הכספים. בקיץ האחרון ארה"ב ובריטניה הטילה סנקציות על הנכסים של ברהום. בעקבות כך, הנכסים הוקפאו. דמות מוכרת אחרת היא מושיר אל-מסרי, ששימש בעיקר כדובר ולא נראה מתחילת המלחמה.
במהלך הפסקת האש הופיעו בפומבי ברצועת עזה שני מפקדי גדודים בזרוע הצבאית של חמאס, שהתברר כי הם חיים למרות הדיוווחים. הראשון הוא מג"ד בית חאנון חוסיין פיאד והשני הוא היית'ם אלחוואג'רי. לפי מקורות ערביים, בחמאס עסקו במהלך הפסקת האש בארגון מחדש של הזרוע ובמינוי בכירים, זאת לאור חיסול של עשרות ממפקדי הזרוע.
